يمكن من خلال برنامج الانتاج متابعة التكاليف حيث يمكن تتبع وتحليل التكاليف المترتبة على الإنتاج والتي تشمل التكاليف المباشرة وغير المباشرة، وذلك بهدف تحديد الأسباب التي تؤدي إلى زيادة التكاليف والعمل على تخفيضها. وتساعد متابعة التكاليف في اتخاذ القرارات الصحيحة فيما يخص إدارة الإنتاج، كما أنها تساعد في تحديد سعر المنتجات بشكل صحيح.